Ролевая игра Rise of the Ronin может похвастаться не только продвинутой боевой системой, берущей всё лучшее, что было в Ninja Gaiden и Nioh, но и возможностью самостоятельно влиять на развитие событий. В игре будет представлено три полноценные фракции, каждая со своими взглядами на будущее Японии. Игрок волен примкнуть к любой из них, для этого ему нужно будет познакомиться с ключевыми персонажами и выполнить для них ряд поручений, способствующих укреплению дружественных отношений.
Улучшая отношения с одними персонажами игрок автоматически будет обрывать связи с другими, так что выбор должен быть максимально продуманным и взвешенным. От этого также будет зависеть и концовка, которых, судя по всему, в Rise of the Ronin будет несколько. На ход истории также будут влиять выборы реплик в диалогах, оказание помощи, спасение или убийство отдельно взятых персонажей, а также выполнение индивидуальных квестов, открывающихся при сближении с кем-то из героев. Очевидно, что игра будет обладать очень высокой вариативностью, способствующей повторным прохождениям.